系统医学 – 细胞分析和工程细胞的设计与建构


科学 - 从发现与解构到设计与建构

一切符号皆是语言 - 概念内涵与符号形式的表征,万物皆可计算,存在就是信息,从牛顿的天体运行规律到莱布尼兹的机器运算方法,探索星球与粒子模型和自然与人工生命,人类认知与行为的意识活动 - 从a-理论与方法和b-观测与技术到c-设计与制造,构成存在与符号相互关系的转换过程。
医学科学与工业发展趋势 - 经验医学与自然观测和工匠技术转型升级到实证科学,从实验医学到系统医学 - 系统生物学,及其工程形态的合成生物学,系统分析与综合(synthesis)的结构理论和实验与计算生物学 - 人工智能-IT与基因工程-BT结合方法,在临床医疗上,从循证医学的概率与统计分析,发展到精准医学 - 个体化与转化医学模式。
生物系统的定量模型和数据分析,基因组智能与人工生物系统设计 - 生物分子与细胞计算机和生物反应器,采用计算机辅助设计与基因组学分析,细胞信号传导与表达调控的设计,基因建构和细胞的组装合成技术 - 细胞分析与合成的微流控芯片技术集成,工程细胞的分子模块设计与装配合成,从细胞分析与模拟到虚拟细胞,建立生物资源和药物分子筛选的资讯数据库,发展代谢工程与细胞工厂的新兴产业。
系统遗传学 --- 系统合成生物技术平台
从生物系统机理分析到人工设计生物,涉及,人工智能与计算机科学和药物分子与生物细胞的设计艺术,细胞类型与细胞系图谱,神经回路-内分泌、免疫细胞的基因回路与表达程序,泛基因组与核心基因组和全基因组关联分析,生物遗传与个体的基因组合模式,细胞进化和人工进化与定向进化,包括:
1-实验生物学 - 纳米科学和分子生物技术与组学(omics)数据分析,次生代谢药物分子筛选,网络药理学与表达谱分析;
2-计算生物学 - 认知科学和软件模拟与虚拟现实,细胞通讯与分子网络和数学模型与生物信息技术;
3-工程生物模型与工程方法的人工生物系统设计,人造器官与组织工程和类器官智能;
4-细胞传感器和代谢工程与生物电子学的工程设计,生物计算机与DNA储存技术;
5-遗传程序与机器设计 - 分子元件与模块设计和人工神经元与人工生命等。
实施的技术方案与产品开发
合成生物学 - 系统生物学的工程形态,细胞代谢的系统分析与工程细胞合成,采用生物信息数据库、计算机软件辅助设计,细胞信号传导路径的相关基因、蛋白质数据分析,开展基因、蛋白质结构与基因组序列的生物信息同源检索,基因相互作用与表达分析,以特异与保守序列作为设计方案。
天然药物筛选与生物制造 - 天然药物与生物资源是一个巨大宝库,药物分子筛选和代谢工程制药,却并没有得到充分发掘,涉及,细胞图谱与基因组技术,已知功能基因的未知序列克隆和已知序列未知功能基因分析,基因修饰的细胞系和生药细胞的细胞株系筛选,分子网络和药物作用的靶向分析,代谢组学和次生代谢反应链与分子表达谱,分子形态与结构分析 - 甾体、芳香族、苷类和生物碱等。
生物传感器与生物反应器 ---- 上中下游衔接 - 1-基因工程与转基因技术、化学合成和软件技术,基因网络与次生代谢反应链的系统分析;2-工程细胞的信号传导路径与基 因调控网络、代谢反应链等人工设计与合成细胞,分子元件与模块的组装合成;3-细胞有效成分提取、工业发酵、过程工程等传统技术。
微-纳流控芯片实验室lab. on chip)- 多种单元组合的芯片,驱动源、信号检测与检测仪器,计算机操作与分析软件和数据处理,在疾病发生过程的调控网络与药物作用的机理研究,程序化分析药物分子靶向和工程细胞的人工合成,微流控(micro-fluidics)芯片的集成技术流程 - 微型化、高通量化与系统化的技术布局:
1-细胞分析与分子检测,分子表达谱与基因的序列分析、生物分子分离,功能基因分析、生物分离与分子提纯;
2-蛋白质与酶的基因调控系统分析,分子模块设计与细胞合成,基因克隆与载体构建,基因的组装合成技术;
3-基因突变与细胞建系,病理细胞系体外分离、突变细胞系,耐药细胞系的突变筛选,生药组织培养与细胞工程;
4-细胞传感器,细胞的分子相互作用机制与药物分析,天然药物次生代谢产物的有效成分与药物分子筛选;
5-工程细胞建系,基因定点整合、特异性与高效表达技术,蛋白质类药物表达,转基因表达系统与代谢工程等。
生物铸造自动化平台(automatic bio-foundry)--- 采用高通量实验-生物技术与大数据计算-信息技术的整合方法,建立自动化实验室与工业标准化的操作流程 - 细胞分子网络的系统设计与装配和工程细胞建系,实现药物分子筛选的规模化和代谢工程与生物炼制,以及类器官与3D打印技术,并进行实验室分析验证和发酵罐技术检测与试生产测试。
邦哲系统生物工程研究所(Benjoe Institute)- 2008年Bj.Zeng创办,致力于系统与合成生物学的技术解决方案,开发细胞分析和工程细胞设计与组装合成的集成技术 - 生物制造的自动化实验室的标准化工业流程,并建立技术孵化器与产业转化平台,涉及,1)策略分析和运筹与决策管理研究,2)生物实验室技术和生物信息资源的互联网资讯与数据库软件 - 同源检索与计算机辅助设计,3)设立视觉艺术工作室(Charlotte Studio)- 网络媒体和创意策划与广告设计。
理念 - 求真务实与开拓创新,艺术构思与技术实践,卓越行为与组织协调的结合,拓展人类的生存能力 - 在极端环境下的医疗与生物技术。
发展规划 -- 从生命机理分析到人工生命设计,开发天然药物的组学技术、药物分子筛选技术与生物制造技术,开展复杂疾病机理的基因表达分析和工程细胞的分子模块设计与合成,涉及,细胞发育和分子进化的遗传分析,基因突变与表达调控的细胞模型,药物作用的分子靶向与代谢网络,天然药物的次生代谢分子鉴定与药理分析等,几个层面:
1)、微流控芯片的设计与制作工艺已经成熟,可以采用纳微米加工技术平台合作,提供设计图纸委托代加工的方式;
2)、生物铸造自动化平台,开发细胞分析与药物分子筛选和工程细胞设计与合成,成为细胞工厂的初试与检测平台;
3)、建立病理细胞系、突变细胞系、生药细胞系和工程细胞系的细胞库,工程细胞系设计与合成的产品规模化与制造的生产流水线。


SysynBio Network